Corso di laurea: BIOLOGIA ED ECOLOGIA MARINA (LM-6) Programmazione per l'A.A. 2017/2018

Percorso STANDARD

Primo anno

Primo semestre

Insegnamento

CFU

SSD

Ore Lezione

Ore Eserc.

Ore Lab

Ore Studio

Attività

Presenza materiale didattico in altra lingua

Lingua

Gruppo opzionale: esami obbligatori opzionali I anno - TAF C - (visualizza)

17509 - BIOLOGIA VEGETALE DEGLI ECOSISTEMI MARINI COSTIERI - ONOFRI Silvano	6	BIO/03	40	-	8	-	Attività formative affini ed integrative	-	ITA
17510 - PARASSITOLOGIA MARINA - MATTIUCCI Simonetta	6	VET/06	40	-	8	-	Attività formative affini ed integrative	-	ITA
17511 - TUTELA DELL'AMBIENTE MARINO (obiettivi) Obiettivi formativi Gli obiettivi del corso sono la trasmissione di una conoscenza approfondita riguardo le principali attività volte alla tutela degli ecosistemi marini. Il corso introduce alle principali caratteristiche degli ecosistemi marini, analizza gli impatti su tali ecosistemi derivanti dalle attività antropiche, fornendo per ogni impatto la descrizione degli strumenti tecnici, gestionali e normativi utilizzati per tutelare il mare. Risultati di apprendimento attesi Conoscenze e capacità di comprensione Al termine dell’attività formativa lo studente acquisirà conoscenze riguardanti i principali impatti antropici sugli ecosistemi marini e le attività volte alla tutela del mare. Lo studente saprà comprendere i molteplici effetti che le attività umane implicano, in termini di squilibrio della stabilità degli ecosistemi marini, e conoscerà gli strumenti di tecnici, gestionali e normativi orientati alla tutela del mare e delle sue risorse. Conoscenza e capacità di comprensione applicate Lo studente saprà orientarsi sulle opzioni di carattere tecnico che possono essere applicate per la tutela degli ecosistemi marini e saprà individuare gli strumenti normativi, nazionali e sovranazionali, attraverso i quali vengono affrontate le questioni che riguardano il mare. Autonomia di giudizio Durante le lezioni e le esercitazioni, viene incoraggiata la discussione aperta sui principali temi affrontati, in particolare riguardo le possibili soluzioni delle emergenze ambientali che riguardano il mare. Lo studente acquisirà quindi autonomia di giudizio sulla base delle conoscenze apprese e del confronto dialettico con i colleghi ed il docente. Abilità comunicative Lo studente acquisirà un appropriato linguaggio tecnico-scientifico durante le lezioni e le esercitazioni, attraverso la conoscenza delle definizioni e dei principali concetti in ecologia marina e tutela dell’ambiente marino. Le abilità comunicative saranno verificate in sede di esame. Capacità di apprendere Lo studente dovrà dimostrare di essere in grado di utilizzare i concetti appresi per ipotizzare i possibili effetti delle attività umane anche in ecosistemi marini diversi da quelli considerati come esempio, sulla base delle caratteristiche dell’ecosistema considerato. - ANGELETTI Dario (programma) Programma Didattica frontale Biologia della conservazione Tassi d'estinzione. Specie in pericolo e specie minacciate. Minacce all’ambiente marino Cambiamenti climatici Inquinamento e suoi effetti Chimico (perdite accidentali, sversamenti, naufragi, prodotti dell'agricoltura, impianti fognari, industriali); Fisico (litter, plastiche); Acustico (militare, industriale, scientifico) Perdita degli habitat e degli ecosistemi Perdita di ambienti costieri dovuta a processi antropici: erosione; urbanizzazione; dragaggi; estrazioni; interramenti Baleneria e protezione dei mammiferi marini; Pesca ed overfishing; Le limitazioni alla pesca. strumenti gestionali e normativi. Convenzioni internazionali Introduzione di specie alloctone; i concetti di Resilienza, Resistenza, Recupero e Reversibilità. Conservazione Definizioni: biodiversità, habitat, comunità, ecosistemi, etc. Concetto di Sostenibilità. Il concetto di 'shifting baseline'. Livello ottimale sostenibile di popolazione (OSP). Livello minimo di sopravvivenza (MVP). Le specie focali: specie indicatrici di comunità o di stato, keystones, specie ombrello, specie flagship. I diversi approcci alla conservazione: protezione delle specie, protezione degli spazi. La gestione integrata della fascia costiera. Approccio ecosistemico. Le AMP. Gli interventi contro l'inquinamento da idrocarburi. Il caso Haven. Il caso Deepwater Horizon. La protezione delle specie e degli ambienti. Convenzioni, protocolli e trattati internazionali, leggi e normative nazionali. Enti per lo studio e la protezione. IWC. IUCN. Normative sulla pesca. CBD (Convention on Biological Diversity). UNCLOS - United Nations Convention on the Law of the Sea. MARPOL. ACCOBAMS. Direttiva Habitat. Marine Strategy Framework. AMP, santuari internazionali, zone protezione speciale: Le finalità. Classificazione. Identificazione, progettazione, gestione. La zonizzazione. Reti di AMP. La realtà italiana e quella internazionale. Gli Enti di gestione. La Governance. Gli stakeholders. La gestione sostenibile delle risorse: pesca, turismo, subacquea. Sistemi di fruizione. Il monitoraggio. Esercitazioni Monitoraggio di uccelli e mammiferi marini ai fini della conservazione; analisi dei dati. Analisi ed discussione di articoli scientifici sui temi affrontati. (testi) Testi consigliati - Materiale didattico fornito dal docente (slides, relazioni tecniche, letteratura scientifica) - Ecologia e protezione dell'ambiente marino costiero – Della Croce, Vietti, Danovaro, 1997, Utet	6	BIO/07	40	-	8	-	Attività formative affini ed integrative	-	ITA
17512 - MONITORAGGIO BIOLOGICO MARINO - ARGENTI Letizia	6	BIO/07	32	-	16	-	Attività formative affini ed integrative	-	ITA

17716 - ECOLOGIA DELLA PESCA E ACQUACOLTURA SPERIMENTALE (obiettivi)

- CROSETTI Donatella

- SCACCO Umberto (programma) (testi)

BIO/07

Attività formative caratterizzanti

ITA

18177 - BIOLOGIA MARINA

- PIERMATTEI Viviana

BIO/07

Attività formative caratterizzanti

ITA

Secondo semestre

Insegnamento	CFU	SSD	Ore Lezione	Ore Eserc.	Ore Lab	Ore Studio	Attività	Presenza materiale didattico in altra lingua	Lingua
15414 - MICROBIOLOGIA MARINA E LABORATORIO
- MODULO A (obiettivi) Il corso consentirà agli studenti di comprendere le peculiari caratteristiche morfologiche, fisiologiche e metaboliche dei microrganismi marini (con particolare riferimento ai procarioti), il loro ruolo nell’ambiente marino e le interazioni con altri organismi. Inoltre consentirà di conoscere le tecniche di base per il loro campionamento e manipolazione in laboratorio. Il corso fornirà un quadro di riferimento per la comprensione di tematiche attuali connesse con i microrganismi marini e le loro potenziali applicazioni (ad es. l'importanza dei microrganismi per gli altri organismi marini, le loro potenzialità in biotecnologia, la pericolosità di alcuni microrganismi e le contromisure necessarie ad annullare potenziali danni di questi). Il corso fornirà gli approfondimenti necessari a comprendere le peculiarità ecologiche dei microrganismi marini in particolare quelli di alcuni ambienti marini estremi. - FENICE Massimiliano	6	BIO/19	32	16	-	-	Attività formative caratterizzanti	-	ITA
- MODULO B (obiettivi) Il corso consentirà agli studenti di comprendere le peculiari caratteristiche morfologiche, fisiologiche e metaboliche dei microrganismi marini (con particolare riferimento ai procarioti), il loro ruolo nell’ambiente marino e le interazioni con altri organismi. Inoltre consentirà di conoscere le tecniche di base per il loro campionamento e manipolazione in laboratorio. Il corso fornirà un quadro di riferimento per la comprensione di tematiche attuali connesse con i microrganismi marini e le loro potenziali applicazioni (ad es. l'importanza dei microrganismi per gli altri organismi marini, le loro potenzialità in biotecnologia, la pericolosità di alcuni microrganismi e le contromisure necessarie ad annullare potenziali danni di questi). Il corso fornirà gli approfondimenti necessari a comprendere le peculiarità ecologiche dei microrganismi marini in particolare quelli di alcuni ambienti marini estremi. - BARGHINI Paolo (programma) Introduzione al corso, test di verifica delle conoscenze di microbiologia generale. Classificazione dei microrganismi. Caratteri classici e caratteri molecolari come criteri per la classificazione dei microrganismi. Identificazione dei microrganismi. Metodi fisiologici: Biolog. Metodi molecolari: estrazione DNA; amplificazione; sequenziamento; confronto in banca dati.Definizione e costruzione di alberi filogenetici. Scelta del metodo; scelta delle sequenze e multiallineamento; scelta dell'outgroup. Il bootstrap. Analisi critica dei risultati ottenuti. Tecnologia del DNA ricombinante. Enzimi di restrizione e realizzazione di una mappa di restrizione. Realizzazione di un costrutto. Plasmidi: vettori di clonaggio, di espressione, di secrezione, di integrazione, vettori shuttle e vettori per lo studio dei promotori. Costruzione di librerie geniche. Teoria della PCR. Evoluzione e applicazioni. PCR Real Time; la chimica dei sistemi di rilevazione; sybr green, sonde di ibridazione o sonde fret, sonde di idrolisi o sonde taqman. Applicazioni: analisi quantitative; rivelazioni delle mutazioni; caratterizzazione dei prodotti. Aspetti teorici della PCR quantitativa. Curva di taratura. Principi di quantificazione. Quantificazione assoluta e relativa. Analisi della curva di melting. Set-up della PCR con controllo interno. Sequenziamento del DNA con metodo Sanger. Le nuove tecnologie NGS. Trasformazione genetica dei procarioti. Trattamento di competenza. Competenza chimica. Elettroporazione. Coniugazione triparentale. Mutazioni. Ricombinazione: modalità e meccanismi. Gene-conversion e crossing over disuguale. Elementi trasponibili (trasposoni): tipologie struttura e meccanismi di azione. Il Plasposone. Biofouling e quorum sensing. Il campionamento: aspetti teorici e pratici per un campionamento corretto e statisticamente significativo. Campionamento di microrganismi marini da ambienti antropizzati e non antropizzati. Conta vitale e totale di microrganismi marini. Isolamento, coltivazione e classificazione (metodi colturali e molecolari) di microrganismi marini. Rilevazione della biodiversità microbica totale di ambienti marini. Biotecnologie dal mare. Screening per la produzione di metaboliti/enzimi di interesse industriale. Analisi microbiologica di acqua marina. (testi) Colin Munn. Marine Microbiology: Ecology and Applications. Garland Science Brock Biologia dei microorganismi: microbiologia generale, ambientale e industriale. 14° edizione (2016). Casa Editrice Ambrosiana. Roberto Danovaro - Biologia Marina: biodiversità e funzionalità degli ecosistemi marini. CittàStudi Edizioni. Barbieri, Bestetti, Galli, Zannoni- Microbiologia ambientale ed elementi di ecologia microbica - Casa Editrice Ambrosiana, edizione 2008.	6	CHIM/11	32	16	-	-	Attività formative caratterizzanti	-	ITA
18121 - BIOLOGIA DELLE ALGHE E E DEI FUNGHI MARINI - PASQUALETTI Marcella	7	BIO/02	48	8	-	-	Attività formative caratterizzanti	-	ITA
18176 - ECOLOGIA, ETOLOGIA ED EVOLUZIONE DEGLI ORGANISMI MARINI
- MODULO A (obiettivi) Il corso ha l’obiettivo di fornire solide conoscenze sui processi ecologici, etologici ed evolutivi che regolano il funzionamento dei sistemi ambientali marini; viene data particolare enfasi ai meccanismi che determinano distribuzione, abbondanza e relazioni con l’ambiente biotico e abiotico degli organismi marini. Il corso si prefigge di esaltare la natura multidisciplinare, interdisciplinare e integrativa dei temi trattati, con l’obiettivo di incentivare gli studenti a confrontarsi con discipline e problemi complessi e multi-scalari, e con la varietà dei metodi di indagine ad essi connaturato. - CANESTRELLI Daniele (programma) Ecologia ed evoluzione biologica. Ambiti di studio, approcci metodologici, scale temporali e spaziali dell’indagine. Comunità marine. Fattori ecologici e pattern di biodiversità. La fascia tidale: cause e conseguenze della zonazione, adattamenti. Interazioni biologiche, struttura delle comunità, metacomunità. Ecologia molecolare ed evolutiva. Principi, metodi e campi dell’indagine. Meccanismi del cambiamento evolutivo. Specie e speciazione. Filogeografia e biogeografia. Diversità e divergenza. Dispersione, migrazione, flusso genico. Genetica del paesaggio. Popolazioni e metapopolazioni. Struttura, diversità e cambiamenti demografici. Dimensione censita, dimensione effettiva, metodi di indagine storico-demografica basati su dati demografici e genetici. Invasioni biologiche. Cause, vettori e percorsi d'invasione. Fattori che determinano il successo d'invasione. Evoluzione degli invasori. Conseguenze eco-evolutive delle invasioni. Invasioni Lessepsiane. Variazioni della linea di costa. Cause, scale temporali, entità dei cambiamenti, conseguenze sulla biodiversità a livello di popolazione, specie, comunità. Storia evolutiva del bacino del Mediterraneo e delle sue coste. Evoluzione tettonica, evoluzione climatica, conseguenze sulla biodiversità. (testi) Bertness, Bruno, Silliman, Stachowicz, 2014. Marine Community Ecology and Conservation. Sinauer Associates. Freeland, Kirk, Petersen, 2011. Molecular Ecology. Wiley. Rilov, Crooks, 2009. Biological Invasions in Marine Ecosystems. Springer. Losos, 2013. The Princeton guide to Evolution. Princeton University Press.	6	BIO/07	32	24	-	-	Attività formative caratterizzanti	-	ITA
- MODULO B (obiettivi) a) OBIETTIVI FORMATIVI Il corso ha l’obiettivo di fornire solide conoscenze sui processi ecologici, etologici ed evolutivi che regolano il funzionamento dei sistemi ambientali marini; viene data particolare enfasi ai meccanismi che determinano distribuzione, abbondanza e relazioni con l’ambiente biotico e abiotico degli organismi marini. Il corso si prefigge di esaltare la natura multidisciplinare, interdisciplinare e integrativa dei temi trattati, con l’obiettivo di incentivare gli studenti a confrontarsi con discipline e problemi complessi e multi-scalari, e con la varietà dei metodi di indagine ad essi connaturato. b) RISULTATI DI APPRENDIMENTO ATTESI Al termine del corso gli studenti dovrebbero aver conseguito obiettivi inerenti conoscenze e abilità: Conoscenze: - Ruolo dei processi eco-eto-evolutivi nella genesi e nel mantenimento dei pattern spazio-temporali di biodiversità marina; - meccanismi di base del processo evolutivo; - principi di demografia e dinamica delle popolazioni marine, e dei processi comportamentali implicati; - meccanismi ecologici, etologici ed evolutivi che regolano le interazioni intraspecifiche e interspecifiche; - Potenzialità applicative e gestionali dei processi eco-eto-evolutivi in ambito marino. Abilità: - capacità di comprensione delle relazioni tra organismi a livello di individuo, popolazione e specie, e di questi con l’ambiente fisico marino; - capacità di applicare le conoscenze acquisite a questioni eco-eto-evolutive; - capacità di illustrare ed argomentare su questioni eco-eto-evolutive complesse e di gestire informazioni su più livelli gerarchici; - capacità di utilizzare approcci scientifici per interpretare la complessità dell’ambiente marino. Il raggiungimento di questo obiettivo verrà favorito da esercitazioni sul campo, e da discussioni collettive su casi di studio emblematici, anche su proposta degli studenti. - CARERE Claudio (programma) Fondamenti di etologia. Storia dello studio del comportamento e sua trasversalità; i quattro quesiti di Tinbergen. Imprinting; effetti materni. Risposta allo stress. Substrati neuroendocrini del comportamento. Ruolo dei geni e dell'ambiente. Il ruolo del comportamento nell’evoluzione. Scelta del partner e sistemi riproduttivi. Prede e predatori. Migrazioni, orientamento e navigazione. Aggressività, territorialità, personalità animali. Comportamenti collettivi. Etologia cognitiva. Benessere animale. Ecologia comportamentale degli organismi marini. Ecologia del comportamento e valutazione delle ipotesi. Convergenze e divergenze evolutive comportamentali; plasticità comportamentale. Adattamenti comportamentali: fauna insulare costiera, ambiente pelagico; immersione nei mammiferi marini, vita in profondità; comportamento sociale; schooling, dinamiche di gruppo e auto-organizzazione; colonialità; cure parentali, territorialità, aggressività; inversione sessuale; strategie di foraggiamento. Orientamento, migrazioni e homing. Cenni di bioacustica; comunicazione chimica; bioluminescenza; elettrolocalizzazione Metodologie di studio. Metodi di cattura e marcatura; disegni sperimentali e misurazione del comportamento sul campo e in condizioni controllate: esempi. Tracking satellitare. Geolocalizzatori. Accelerometri. Radar e sonar. Conservazione e gestione. Ecotossicologia comportamentale; interferenti endocrini; effetti del disturbo antropico. Effetti dei cambiamenti climatici. Il comportamento delle specie invasive. Importanza degli studi comportamentali nella conservazione e gestione della biodiversità marina. Comportamento e acquacultura. (testi) J.R. Krebs, N.B. Davies (eds) 2012 Behavioural Ecology. An Evolutionary Approach- Blackwell P. Martin, P.P.G. Bateson 2010 La misurazione del comportamento. Una guida introduttiva. Raffaello Cortina Editore J. Alcock. Etologia. Un approccio evolutivo. III ed italiana sulla VIII americana, Zanichelli. A. Manning, M.S. Dawkins 2003 Il comportamento animale. Bollati Boringhieri. (Ultima edizione in inglese Cambridge University Press 2012)	5	BIO/05	32	8	-	-	Attività formative caratterizzanti	-	ITA

Secondo anno

Primo semestre

Insegnamento

CFU

SSD

Ore Lezione

Ore Eserc.

Ore Lab

Ore Studio

Attività

Presenza materiale didattico in altra lingua

Lingua

17506 - OCEANOGRAFIA APPLICATA E DINAMICA DEGLI ECOSISTEMI

- MARCELLI Marco

BIO/07

Attività formative caratterizzanti

ITA

Gruppo opzionale: LIBERI (opzione tra due votazioni) - Percorso STANDARD - (visualizza)

17504 - LIBERI	12		96	-	-	-	Attività formative a scelta dello studente (art.10, comma 5, lettera a)		ITA
17714 - LIBERI (IDONEO)	12		96	-	-	-	Attività formative a scelta dello studente (art.10, comma 5, lettera a)		ITA

17507 - CONSERVAZIONE DELLA BIODIVERSITA' MARINA

- CIMMARUTA Roberta

BIO/07

Attività formative caratterizzanti

ITA

Secondo semestre

Insegnamento	CFU	SSD	Ore Lezione	Ore Eserc.	Ore Lab	Ore Studio	Attività	Presenza materiale didattico in altra lingua	Lingua
15422 - TESI SPERIMENTALE	30		-	-	-	-	Per la prova finale e la lingua straniera (art.10, comma 5, lettera c)		ITA
17505 - TIROCINIO	4		-	-	-	-	Ulteriori attività formative (art.10, comma 5, lettera d)		ITA