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Docente
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SELBMANN Laura
(programma)
PROGRAMMA LEZIONI FRONTALI:
Regno funghi, definizione, circoscrizione classica e attuale. origine ed evoluzione.
Biologia ed ecologia: La cellula fungina (caratteristiche differenziali rispetto alla cellula vegetale, parete, sostanze di riserva, organuli peculiari, setti. Differenziamento, struttura e crescita. Spore. Sporogenesi e dispersione. Tropismi, condizioni ambientali per la crescita. Principali vie metaboliche, metaboliti primari e secondari. Riproduzione e cicli vitali. Fasi anamorfe e teleomorfe. Eterocariosi e parasessualità.
Ecologia: Funghi simbionti, parassiti e saprotrofi. Successioni.
Sistematica: approccio fenetico e cladistico. Caratteri apomorfi e plesiomorfi, concetti di omologia, analogia e omoplasia; metodi di studio della filogenesi (approcci morfologici, paleontologici, biochimici e genetico-molecolari); filosofie sistematiche; Costruzione di alberi filogenetici; nodi, internodi OTU, cladi e gradi; monofilia, polifilia e parafilia. Concetto di outgroup.
Filogenesi molecolare: Cenni di tecniche RFLP (Restriction Fragment Lenght Polymorphism), RADP (Randomly Amplified Polymorphic DNA) ed AFLP (Amplified Fragments Lenght Polymorphism). Sequenziamento: caratteristiche dei markers molecolari. I geni ribosomali. Allineamento. Inferenza filogenetica da sequenze molecolari: distance methods e discrete methods. Bootstrapping.
Filogenesi e caratteristiche dei Phyla e subphyla del Regno Fungi.
PROGRAMMA ESERCITAZIONI DI LABORATORIO:
Riconoscimento di una selezione di funghi rappresentativi dei diversi gruppi sistematici.
Tecniche di filogenesi molecolare. Estrazione DNA da ceppi fungini selezionati; amplificazione di porzioni geniche ribosomali. Elettroforesi su gel di agarosio. Sequenziamento, proofreading delle sequenze con programmi dedicati. Confronto delle sequenze ottenute con quelle depositate nelle banche dati in rete (NCBI). Allineamento. Costruzione alberi con l'uso di diversi algoritmi (Neigbour Joining, Maximum Likelyhood).
(testi)
Gams W. et al., 2001. CBS Course of Mycology. Centraalbureau voor Schimmelcultures, Utrecht, The Netherlands.
CBS Laboratory Manual for Fungal Biodiversity. CBS Fungal Biodiversity Centre 2009.
Deacon J. W. 2000. Micologia moderna. Calderini ed agricole.
Deacon J. W. 2005. Fungal Biology. 4th edition Blackwell.
Appunti dalle lezioni e materiale bibliografico saranno distribuiti dal docente e caricati sulla piattaforma Moodle.
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